Check & Trace permite sorotipagem rápida de Salmonella baseada em tecnologia de DNA
Todos os organismos vivos são definidos pela natureza de seu código genético. As últimas décadas viram uma revolução de tecnologias para determinar o código genético completo de qualquer organismo. Da mesma forma, foram desenvolvidas metodologias que podem usar esses códigos para identificar exclusivamente organismos individuais e discriminá-los de parentes próximos. Desenvolvemos uma tecnologia inovadora de impressão digital de DNA, chamada “Check & Trace”
para detectar e caracterizar qualquer organismo.
Check & Trace é um novo sistema de teste genético para confirmar e identificar rapidamente múltiplos sorotipos de Salmonella em um único teste, partindo de uma colônia pura.
Nosso produto Check & Trace Salmonella 1.0 é baseado na detecção de microarranjos e nosso novo Check & Trace Salmonella 2.0 é baseado em PCR em tempo real. Nosso primeiro produto detecta até 300 sorotipos e conta com o suporte de nossa equipe técnica caso seja encontrado um código genético indefinido.
Nosso novo Check & Trace Salmonella 2.0 possui um fluxo de trabalho “plug-and-play” muito simples, fornecendo resultados de testes em duas horas. Pode detectar 59 sorotipos; aqueles encontrados principalmente em áreas de produção de alimentos.
O princípio do sistema Check&Trace Salmonella é baseado no reconhecimento molecular específico de sequências alvo de DNA e na subsequente amplificação com primers universais.
A importância de testar Salmonella
De acordo com o Relatório de Zoonoses One Health da UE, a Salmonella é a segunda infecção gastrointestinal de origem alimentar mais notificada em humanos, com mais de 52.000 casos confirmados em 2020.
A salmonella é generalizada e difícil de controlar
A salmonelose não é uma doença importante nas aves. Existem dois tipos que causam doenças (dos 2.600), Gallinarum e Pullorum, mas as empresas conseguem controlá-los muito bem. O problema são outros tipos de Salmonella que podem causar doenças em humanos e que muitas vezes se originam de alimentos, principalmente em carne fresca.
A erradicação completa da Salmonella da produção avícola é uma meta incrivelmente difícil devido à grande variedade de sorotipos e à epidemiologia altamente complexa deste microrganismo. Além disso:
- As bactérias estão espalhadas pela natureza e são capazes de sobreviver semanas ou meses;
- A Salmonella pode ser constantemente reintroduzida nas áreas de produção através de alimentos contaminados, solo, sistemas de transporte e materiais provenientes de outras áreas de produção.
- A Salmonella também pode permanecer aderida por períodos mais longos a superfícies e equipamentos;
Os animais carregam Salmonella na maior parte das vezes sem apresentarem quaisquer sintomas; - A capacidade de gerir Salmonella com segurança é complexa e combina muitos elementos diferentes, incluindo biossegurança, diagnóstico e protocolos de vacinação.
Salmonella identificada, o que vem a seguir?
Uma vez confirmada a Salmonella, há a necessidade urgente de identificar o sorovar. A cadeia (criadores, incubatório, engorda e ração) deve ser investigada para a obtenção e sorotipagem dos isolados para assim, se encontrar a fonte da contaminação. Quanto mais rápido os sorotipos forem identificados, mais cedo uma estratégia de tratamento poderá ser definida.
Tecnologia de ponta
Sorotipagem através de diferenças de sequência de DNA
Comparação entre tipagem molecular e sorotipagem convencional
Método de sorotipagem fenotípico padrão
(Esquema White–Kauffmann–Le minor)
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Resultados subjetivos (baseados em interpretação manual)
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Necessária experiência e muito treinamento; São necessários diferentes testes e soros para diferentes serovares
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Dependente da expressão fenotípica de antígenos
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Tempo para resultado: 5-14 dias
Check&Trace Salmonella
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Resultados objetivos, graças aos resultados do software
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Treinamento simples (1 a 2 dias)
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Teste único
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Alta sensibilidade e especificidade
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30 alvos de genomas de Salmonella
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Resultados em horas
Os protocolos padrão para detecção de Salmonella são demorados, levando vários dias para gerarem um resultado de positivo ou negativo. (ISO-6579/1). Se positivo para Salmonella, muitos países exigem tipagem adicional para avaliações epidemiológicas e de risco à saúde. Tradicionalmente, isso é feito usando sorotipagem para antígenos lipopolissacarídeos somáticos (O) e proteínas flagelares (H) (ISO-6579/3). No entanto, as Salmonellas são geneticamente complexas, com mais de 2 400 serovares possuindo várias combinações dos 46 antígenos O e dos 85 antígenos H (3). Assim, uma vez positiva, a tipagem adicional de uma Salmonella pode novamente levar vários dias para ser concluída, exigindo muitos anti-soros O e H para a tipagem completa.
A tipagem de DNA difere da sorotipagem. Com a sorotipagem é detectada a presença de antígenos na superfície celular e flagelos. Isto é baseado na expressão de genes localizados em dois segmentos específicos do genoma da Salmonella. O ensaio CTS detecta variação genética em 21 loci espalhados por todo o genoma de Salmonella: isso gera genótipos específicos de Salmonella, também chamados Genovares. O banco de dados CTS vincula Genovares a uma coleção de sorovares de Salmonella bem caracterizados.
Com o ensaio CTS, a confirmação e a tipagem de Salmonella podem ser realizadas em horas a partir de bactérias de uma placa de XLD ou Ágar Nutriente (AN). A presença de sequências alvo de DNA para tipagem e confirmação é detectada em paralelo com vários controles internos. O CTS utiliza um processo rápido e simples de preparação de amostras e minimiza a intervenção do operador.
